Ο Βαρδής Βαρδινογιάννης γεννήθηκε τον Δεκέμβριο του 1933 στην Επισκοπή Ρεθύμνου και είναι το πέμπτο από τα οκτώ παιδιά -Παύλος, Αμαλία, Σήφης, Νίκος, Γιώργος, Θεόδωρος και Ελένη- του Ιωάννη Βαρδινογιάννη και της Χρυσής Θεοδωρουλάκη. Ακολουθώντας την παράδοση της οικογένειας επέλεξε μια καριέρα στο ναυτικό και μπήκε στη Σχολή Ναυτικών Δοκίμων, από την οποία αποφοίτησε το 1955, όμως ήταν μια καριέρα σύντομη λόγω της αντιστασιακής του δράσης.
Ο Βαρδής Βαρδινογιάννης αποστρατεύτηκε τον Ιούλιο του 1967 από το δικτατορικό καθεστώς λόγω της αντιστασιακής του δράσης με το βαθμό του πλωτάρχη και εξορίστηκε στην Αμοργό.
Παρότι ο ίδιος ο επιχειρηματίας δεν είχε μιλήσει ποτέ δημόσια για την εξορία του, η Μαριάννα Βαρδινογιάννη είχε κάνει μια σχετική ανάρτηση στο Instagram τον Απρίλιο του 2020.
Περιέγραψε πως ως νέα κοπέλα άφησε πίσω της δύο μικρά παιδιά και ένα βρέφος στη μητέρα της και εκείνη πήγε να βρει τον εξόριστο Βαρδή Βαρδινογιάννη στην Αμοργό.
«Εκεί ένιωσα και δεν θα το ξεχάσω ποτέ, πόση ζεστασιά και πόση καλοσύνη μπορεί να χωρέσει ένα τόσο δα καμαράκι. Ήταν η αλληλεγγύη των ντόπιων που μας κράτησε όρθιους και τους ευχαριστώ μέσα από τα βάθη της καρδιάς μου για αυτή τους την αγάπη και τη συμπαράσταση. Όλοι τότε μαζί και ο κίνδυνος απέναντί μας. Το τότε δεν συγκρίνεται με το τώρα. Γιατί ο εχθρός, ο κίνδυνος είναι διαφορετικός» είχε γράψει χαρακτηριστικά η Μαριάννα Βαρδινογιάννη, συνοδεύοντας την ανάρτησή της από μια παλιά φωτογραφία του ζευγαριού από την Αμοργό.