Συνταγματική κρίθηκε από το Συμβούλιο της Επικρατείας η παύση λειτουργίας της Ανώτατης Εκκλησιαστικής Ακαδημίας Θεσσαλονίκης και η Διοίκηση οφείλει να ρυθμίσει τα ζητήματα των σπουδαστών που μεταφέρονται στην Αθήνα.
Ειδικότερα με την υπ’ αριθμ. 1919/2024 απόφαση της Ολομέλειας του Συμβουλίου κρίθηκε, κατά πλειοψηφία, ότι η παύση λειτουργίας της Ανώτατης Εκκλησιαστικής Ακαδημίας Θεσσαλονίκης και η μεταφορά των εν ενεργεία σπουδαστών της στην αντίστοιχη σχολή της Αθήνας δεν έρχεται σε αντίθεση με τις συνταγματικές διατάξεις περί επικρατούσας θρησκείας και θρησκευτικής ελευθερίας, αλλά εξυπηρετεί την ορθολογική και αποτελεσματική λειτουργία της δημόσιας Διοίκησης.
Επίσης, το Δικαστήριο έκρινε ότι η αλλαγή αυτή δεν παραβιάζει την δικαιολογημένη εμπιστοσύνη των εν ενεργεία σπουδαστών.
Διαπίστωσε όμως ότι η αδράνεια της Διοίκησης να ρυθμίσει τα ζητήματα σχετικά με την κατάσταση των μεταφερόμενων σπουδαστών (υπολειπόμενα εξάμηνα φοίτησης, κατοχύρωση βαθμολογίας, στέγαση, σίτιση κ.λπ.) δεν είναι νόμιμη.